دانشکده کشاورزی دانشگاه مراغه بعنوان اولین واحد دانشگاه مراغه در سال ۱۳۶۶ تحت عنوان آموزشکده کشاورزی مراغه شروع به کار کرد و در سال ۱۳۷۷ به دانشکده ارتقا یافت. دانشکده دارای شش گروه آموزشی
علوم و مهندسی آب،
علوم و مهندسی باعبانی،
علوم و مهندسی خاک،
مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی،
مهندسی گیاهپزشکی و
مهندسی مکانیک بیوسیستم میباشد.
در حال حاضر دانشکده کشاورزی دانشگاه مراغه دارای دو رشته در مغطع دکتری، 11 رشته در مقطع کارشناسی ارشد و 7 رشته در مغطع کارشناسی می باشد.